mir

• mir package
  • Subpackages
    • mir.basic package
      • Submodules
      • mir.basic.gene_usage module
      • mir.basic.pgen module
      • mir.basic.token_tables module
      • mir.basic.token_tables_pl module
      • mir.basic.tokens module
      • mir.basic.alphabets module
      • mir.basic.aliases module
      • mir.basic.mirseq_compat module
    • mir.biomarkers package
      • Practical notes
      • Submodules
      • mir.biomarkers.motif_logo module
      • mir.biomarkers.token_stats module
      • mir.biomarkers.tcrnet module
      • mir.biomarkers.alice module
      • mir.biomarkers.gliph module
      • mir.biomarkers.metaclonotype_cluster module
    • mir.common package
      • Submodules
      • mir.common.clonotype module
      • mir.common.diversity module
      • mir.common.filter module
      • mir.common.alleles module
      • mir.common.gene_library module
      • mir.common.parser module
      • mir.common.repertoire module
      • mir.common.metaclonotype module
      • mir.common.single_cell module
      • mir.common.single_cell_parser module
      • mir.common.single_cell_repair module
      • mir.common.single_cell_util module
      • mir.common.sampling module
      • mir.common.pool module
      • mir.common.control module
      • mir.common.io_parallel module
      • mir.common.repertoire_dataset module
      • Module contents
    • mir.comparative package
      • Submodules
      • mir.comparative.overlap module
      • mir.comparative.vdjbet module
      • mir.comparative.vdjbet_workflow module
    • mir.distances package
      • Submodules
      • mir.distances.aligner module
      • mir.distances.seqdist module
      • mir.distances.tcrdist module
    • mir.embedding package
      • Submodules
      • mir.embedding.bag_of_kmers module
      • mir.embedding.prototypes module
      • mir.embedding.tcremp module
    • mir.graph package
      • Search behavior
      • Submodules
      • mir.graph.distance_utils module
      • mir.graph.edit_distance_graph module
      • mir.graph.neighborhood_enrichment module
      • mir.graph.token_graph module
      • mir.graph.single_cell_pairing module
      • Module contents
    • mir.ml package
    • mir.utils package
      • Submodules
      • mir.utils.embedding_diagnostics module
      • mir.utils.stats module
      • mir.utils.notebook_assets module
      • mir.utils.memory_debug module
      • mir.utils.shared_memory module
      • mir.utils.metaclonotype_clustering module
      • mir.utils.parser_cli module
  • Module contents
    • get_resource_path()